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清研智庫(kù):11天12篇國(guó)際論文,我們對(duì)新冠病毒傳播知道了什么?

作者: 曹蘭天 清研智庫(kù)研究員 ?劉沂銘 清研智庫(kù)研究員

面對(duì)突如其來(lái)的新型冠狀病毒肺炎疫情,全球科研團(tuán)隊(duì)通過(guò)調(diào)研、實(shí)驗(yàn)、數(shù)據(jù)分析等方法,對(duì)疫情進(jìn)行了研究,并在預(yù)印本、期刊等平臺(tái)上發(fā)布了一系列相關(guān)研究論文,我們總結(jié)和梳理了有關(guān)新冠病毒的國(guó)際學(xué)術(shù)研究。

截止到2月4日,根據(jù)條件“主題 = Novel Coronavirus or 2019-nCoV”在Web of Science數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行搜索,獲得文獻(xiàn)48篇,經(jīng)人工判斷與新冠病毒相關(guān)30篇。同時(shí),根據(jù)條件“term = 2019-nCov”在預(yù)發(fā)布平臺(tái)BioRxiv上進(jìn)行搜索,獲得相關(guān)論文33篇。

針對(duì)新冠病毒肺炎的研究主要集中在病毒傳播與預(yù)測(cè)模型、病毒特征分析與藥物研究、新聞信息綜述等方面,期刊論文與預(yù)發(fā)布平臺(tái)論文相比,前者更傾向于新聞信息綜述,后者則更多的是病毒傳播與模型預(yù)測(cè)、藥品研發(fā)等等。期刊論文中,研究主題分布為病毒特征6篇、藥物研制3篇、信息搜集13篇、模型預(yù)測(cè)1篇、傳播7篇,其中,中國(guó)發(fā)表了12篇、國(guó)外18篇;預(yù)發(fā)布平臺(tái)論文中,研究主題分布為病毒傳播與預(yù)測(cè)模型研究12篇、病毒特征分析與藥物研究21篇,,其中,中國(guó)發(fā)表了19篇、國(guó)外14篇。本研究主要總結(jié)的主題是病毒傳播,對(duì)于描述病毒特征的論文未做盤點(diǎn)。

代表性主要研究成果梳理如下:

  1. Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin

作者:中科院武漢病毒所石正麗研究團(tuán)隊(duì)

發(fā)表時(shí)間:2020.01.22

主要內(nèi)容:武漢新型冠狀病毒2019-nCoV與一種蝙蝠中的冠狀病毒的序列一致性高達(dá)96%,推測(cè)2019-nCoV或來(lái)源于蝙蝠。

  1. A mathematical model for simulating the transmission of Wuhan novel Coronavir

作者:廈門大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院陳田木團(tuán)隊(duì)

發(fā)表時(shí)間:2020.01.19

主要內(nèi)容:研究人員建立了一個(gè)Bats-Hosts-Reservoir-People傳播數(shù)學(xué)模型,以模擬從感染源(可能是蝙蝠)到人類感染的潛在傳播,根據(jù)模型計(jì)算基本復(fù)制數(shù),以評(píng)估2019-nCoV的傳導(dǎo)性。

  1. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019-nCoV

作者:瑞士伯爾尼大學(xué)社會(huì)與預(yù)防醫(yī)學(xué)研究所Julien Riou等人

發(fā)表時(shí)間:2020.01.23

主要內(nèi)容:研究人員對(duì)疫情早期暴發(fā)軌跡進(jìn)行隨機(jī)模擬,發(fā)現(xiàn)新冠病毒存在持續(xù)的人傳人的潛力,且傳播特征與嚴(yán)重急性呼吸道綜合征相關(guān)的冠狀病毒(SARS-CoV)和1918年大流行性流感具有類似程度,這些發(fā)現(xiàn)強(qiáng)調(diào)了加強(qiáng)篩查、監(jiān)測(cè)和控制工作的重要性。

  1. 2019-20 Wuhan coronavirus outbreak: Intense surveillance is vital for preventing sustained transmission in new locations

作者:牛津大學(xué)數(shù)學(xué)研究所R.N.?Thompson

發(fā)表時(shí)間:2020.01.24

主要內(nèi)容:利用47名受感染患者從癥狀出現(xiàn)到住院治療的時(shí)間數(shù)據(jù),估計(jì)輸入病例之后出現(xiàn)持續(xù)人際傳播的概率,評(píng)估冠狀病毒到達(dá)其他國(guó)家時(shí)持續(xù)傳播的風(fēng)險(xiǎn),強(qiáng)調(diào)世界各國(guó)當(dāng)前監(jiān)測(cè)工作的重要性。

  1. Transmission dynamics of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV)

作者:廣東省疾病預(yù)防控制中心學(xué)術(shù)團(tuán)隊(duì)

發(fā)表時(shí)間:2020.01.25

主要內(nèi)容:收集2020年1月23日前2019-nCoV確診病例的病歷、流行病學(xué)調(diào)查或官網(wǎng)資料,利用指數(shù)增長(zhǎng)(EG)和最大似然估計(jì)(ML)估計(jì)2019-nCoV和SARS的繁殖數(shù)?,結(jié)論是2019-nCoV可能比2003年爆發(fā)的SARS具有更高的大流行風(fēng)險(xiǎn),需要更嚴(yán)格的控制和預(yù)防戰(zhàn)略和措施,以遏制其進(jìn)一步蔓延。

  1. The digestive system is a potential route of 2019-nCov infection: a bioinformatics analysis based on single-cell transcriptomes

作者:第二軍醫(yī)大學(xué)長(zhǎng)征醫(yī)院學(xué)術(shù)團(tuán)隊(duì)

發(fā)表時(shí)間:2020.01.30

主要內(nèi)容:研究人員分析了4個(gè)含有單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù)集,發(fā)現(xiàn)消化系統(tǒng)和呼吸系統(tǒng)也是2019-nCov感染的潛在途徑。

  1. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of?Novel?Coronavirus-Infected Pneumonia

作者:中國(guó)疾病預(yù)防控制中心Li, Qun等

發(fā)表時(shí)間:2020.01.29

出版物:《The New England Journal of Medicine》

主要內(nèi)容:研究人員收集2020年1月22日之前報(bào)告的NCIP實(shí)驗(yàn)室確診病例的人口統(tǒng)計(jì)學(xué)特征、接觸史和疾病時(shí)間表,描述病例特點(diǎn)并估計(jì)關(guān)鍵的流行病學(xué)時(shí)延分布。

  1. Importation and Human-to-Human Transmission of a?Novel?Coronavirus?in Vietnam

作者:胡志明市巴斯德研究所Phan, Lan T等

發(fā)表時(shí)間:2020.01.28

出版物:《The New England Journal of Medicine》

主要內(nèi)容:研究新冠病毒在越南的輸入和人際傳播

  1. The Extent of Transmission of?Novel?Coronavirus?in Wuhan, China, 2020

作者:北海道大學(xué)醫(yī)學(xué)院Nishiura, Hiroshi等

發(fā)表時(shí)間:2020.01.24

出版物:《Journal of Clinical Medicine》

主要內(nèi)容:根據(jù)2020年1月24日前13起出口事件的報(bào)告,作者分析并預(yù)估中國(guó)新冠肺炎的累計(jì)發(fā)病率和最可信的感染數(shù)字單位。

  1. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019?novel?coronavirus?indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster

作者:香港大學(xué)醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)系Chan, Jasper Fuk-Woo等

發(fā)表時(shí)間:2020.01.24

出版物:《Lancet》

主要內(nèi)容:對(duì)家庭聚集發(fā)病案例的患者的基因序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析。

  1. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified?coronavirus?may boost cross-species transmission from snake to human

作者:四川農(nóng)業(yè)大學(xué)Chen, Rui等

發(fā)表時(shí)間:2020.01.22

出版物:《Virus Research》

主要內(nèi)容:研究新冠病毒的跨物種傳播,根據(jù)新鑒定的2019-nCoV冠狀病毒的現(xiàn)有序列,結(jié)合不同動(dòng)物物種之間的相對(duì)同義密碼子使用(RSCU)偏差,進(jìn)行全面的序列分析和比較。研究結(jié)果表明,與其他動(dòng)物相比,蛇是2019-nCoV最有可能的野生動(dòng)物宿主,穗糖蛋白內(nèi)的同源重組可能有助于從蛇到人類的跨物種傳播。

  1. Potential of large ‘first generation’ human-to-human transmission of?2019-nCoV

作者:武漢生物工程大學(xué)病毒載體工程研究中心Li, Xingguang等

發(fā)表時(shí)間:2020.01.30

出版物:《Journal of Medical Virology》

主要內(nèi)容:對(duì)病毒基因組序列進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育和似然映射分析,研究結(jié)果表明: 2019-nCoV的星型信號(hào)和拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)可能預(yù)示著潛在的大規(guī)模“第一代”人際病毒傳播。

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